RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465245.1

TRA2B-208, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 3

Gene TRA2B, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1B0GUT8	65 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	HIGD1C	A8MV81	97 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1B0GW15	77 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	PPP1R17	O96001	155 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	RIG	Q13278	110 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	S100A8	P05109	93 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	AMT	P48728	403 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	COTL1	Q14019	142 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	ADIRF	Q15847	76 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	NCR2	O95944	276 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245		V9GYV3	84 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A0U1RQV1	116 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245		H7C423	109 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	CARD19	Q96LW7	228 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245		F8W036	122 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245		C9JQL5	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	TCAP	O15273	167 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	FOXI1	Q12951	378 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245		I3L3M4	83 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	APCS	P02743	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	MT-ND4L	P03901	98 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ST20	Q9HBF5	79 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	MT-ND6	P03923	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	RAB4A	P20338	218 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	PMCH	P20382	165 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	XCL1	P47992	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	PTTG1IP	P53801	180 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	HBB	P68871	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	PPBP	P02775	128 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	SYCN	Q0VAF6	134 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	VCY	O14598	125 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	CCL25	O15444	150 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	GAGE2B	Q13066	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1W2PNN7	141 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	LCE2B	O14633	110 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	FGF6	P10767	208 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	PRR4	Q16378	134 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	FCER1G	P30273	86 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	CKS2	P33552	79 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	CAMP	P49913	170 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1B0GXF2	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRA2B-208	ENST00000465245	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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