RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PHOX2AO14813 284 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 GAS8-AS1O95177 125 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OSTCQ9NRP0 149 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.23□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.22□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CCL25O15444 150 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 RAB4AP20338 218 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 XCL1P47992 114 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MAJINQ3KP22 176 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.21□□□□□ -0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.19□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf77A4D0Y5 90 aa13.19□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF727A8MUV8 499 aa13.19□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CD164L2Q6UWJ8 174 aa13.19□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 STPG4Q8N801 248 aa13.19□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 A0A096LNI7 61 aa13.18□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SS18Q15532 418 aa13.18□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 AMN1Q8IY45 258 aa13.18□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 TNXBP22105 4242 aa13.18□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R17O96001 155 aa13.17□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.17□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 V9GYV3 84 aa13.17□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 RIGQ13278 110 aa13.16□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CARD19Q96LW7 228 aa13.16□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 VCYO14598 125 aa13.15□□□□□ -0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 NRACQ8N912 160 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 NUP35Q8NFH5 326 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ISOC2Q96AB3 205 aa13.14□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.13□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R2P9O14990 202 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FCER1GP30273 86 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SYCNQ0VAF6 134 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00526Q96FQ7 95 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa13.12□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL4Q99706 377 aa13.11□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SMKR1H3BMG3 65 aa13.1□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 CAMPP49913 170 aa13.1□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.1□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01600Q96MT4 127 aa13.1□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00862A6NCI5 91 aa13.08□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 COX7A2LO14548 114 aa13.08□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.08□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.08□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GW15 77 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 MALP21145 153 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 PTTG1IPP53801 180 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 ADIRFQ15847 76 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM18Q96B42 140 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf78Q9BR46 151 aa13.07□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TCAPO15273 167 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK6Q6UWN8 80 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 NAT8Q9UHE5 227 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf48Q96LS8 159 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 C9JQL5 133 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZRP5 223 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZUT4 128 aa13.03□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.03□□□□□ -0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YXV3 536 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 APOMO95445 188 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 PEA15Q15121 130 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 REG3GQ6UW15 175 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.02□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 CKS2P33552 79 aa13□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE2BQ13066 116 aa13□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF6BO95407 300 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 S100A8P05109 93 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 RNF151Q2KHN1 245 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 LRP2P98164 4655 aa12.99□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 F8W036 122 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf38Q86SI9 138 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.98□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GXF2 115 aa12.97□□□□□ -0.33
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PNN7 141 aa12.97□□□□□ -0.33
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