RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705		F8W036	122 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	S100A8	P05109	93 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CTBP2-204	ENST00000395705	FOXI1	Q12951	378 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	UQCC3	Q6UW78	93 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	C20orf78	Q9BR46	151 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	KIR2DL4	Q99706	377 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	PANO1	I0J062	215 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	TCAP	O15273	167 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	CCL25	O15444	150 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	XCL1	P47992	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	COMMD7	Q86VX2	200 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		10.81	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705		Q6ZUT4	128 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM104A	Q969W3	186 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.8	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	ORMDL3	Q8N138	153 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	PRELID3A	Q96N28	172 aa		10.79	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	PHOX2A	O14813	284 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	PPBP	P02775	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
CTBP2-204	ENST00000395705	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.77	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		10.76	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	SS18	Q15532	418 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		10.75	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		10.74	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.74	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		10.74	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.74	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	PRSS47	A8MTI9	375 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM18	Q96B42	140 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.73	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.72	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.71	□□□□□ -0.69
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705		Q8N8P6	123 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	RAB5A	P20339	215 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	COX6A2	Q02221	97 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	C5orf38	Q86SI9	138 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		10.69	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	HERC1	Q15751	4861 aa		10.68	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	COX7A2L	O14548	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.67	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A087WYN8	130 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	IFITM10	A6NMD0	228 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	MAL	P21145	153 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTBP2-204	ENST00000395705	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7

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