RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX7CP15954 63 aa10.82□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM223BA6NKX1 122 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX7A2LO14548 114 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 EBI3Q14213 229 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00467Q9BRT7 94 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00526Q96FQ7 95 aa10.81□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.8□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLPIP03973 132 aa10.8□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.8□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.79□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8NA96 180 aa10.79□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SIRPDQ9H106 197 aa10.79□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPANXCQ9NY87 97 aa10.79□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOCS3O14543 225 aa10.78□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.78□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITPR1Q14643 2758 aa10.78□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATOX1O00244 68 aa10.78□□□□□ -0.68
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.77□□□□□ -0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0J9YX75 114 aa10.77□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.77□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTORP42345 2549 aa10.77□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 C4orf26Q17RF5 130 aa10.77□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 IMUPQ9GZP8 106 aa10.77□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCR3O14931 201 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAX4O43316 350 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZANQ9Y493 2812 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 MALP21145 153 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB131AP59861 70 aa10.76□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa10.75□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZSN1 163 aa10.75□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.75□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFHR3Q02985 330 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 LY6DQ14210 128 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 LECT2O14960 151 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRB1P04280 392 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.74□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCANP1Q8TF63 244 aa10.74□□□□□ -0.69
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CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf85Q96MD7 179 aa10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 USMG5Q96IX5 58 aa10.73□□□□□ -0.69
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.72□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.71□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2L6O14933 153 aa10.71□□□□□ -0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHG2P01859 326 aa10.71□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.71□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACANP16112 2415 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP17L23D6RBM5 183 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 COPS9Q8WXC6 57 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 HILS1P60008 231 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf197Q8N268 126 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00846Q9NV44 126 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFA1O15239 70 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 XCL2Q9UBD3 114 aa10.7□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A087WYN8 130 aa10.69□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 F5H768 121 aa10.69□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB136Q30KP8 78 aa10.69□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.68□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.68□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.68□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa10.68□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.67□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.67□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 FLNCQ14315 2725 aa10.67□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 GHRHP01286 108 aa10.67□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERP2Q8N6R1 65 aa10.67□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PPR1 153 aa10.66□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 DPH3Q96FX2 82 aa10.66□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.66□□□□□ -0.7
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