RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264993.7

CDV3-201, Transcript of CDV3 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDV3, Length 3,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3-201ENST00000264993 Q6ZSN1 163 aa14.74□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.74□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 LRRK2Q5S007 2527 aa14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 SOCS3O14543 225 aa14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 COX6A2Q02221 97 aa14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 DNAL4O96015 105 aa14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.73□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 IGHV1-69P01742 117 aa14.72□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.72□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 PRB1P04280 392 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 SIRPDQ9H106 197 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 NDUFA4O00483 81 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 EBI3Q14213 229 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.71□□□□□ -0.05
CDV3-201ENST00000264993 A0A1W2PPR1 153 aa14.71□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 UQCRQO14949 82 aa14.71□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 CFHR3Q02985 330 aa14.71□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.7□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.7□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 NRGNQ92686 78 aa14.7□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.7□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 IGHG2P01859 326 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 J3KT08 172 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 PEMTQ9UBM1 199 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 KLLNB2CW77 178 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 LINC00643Q86TS7 51 aa14.69□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.68□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 C4orf26Q17RF5 130 aa14.68□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 NF1P21359 2839 aa14.67□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 PFN2P35080 140 aa14.66□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 NCR3O14931 201 aa14.66□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 TRACP01848 142 aa14.66□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.66□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 COX7A2LO14548 114 aa14.65□□□□□ -0.06
CDV3-201ENST00000264993 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 DEFB136Q30KP8 78 aa14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FAM223BA6NKX1 122 aa14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 MED14OSP0DP75 135 aa14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.64□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 COX7CP15954 63 aa14.63□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 C5orf47Q569G3 176 aa14.63□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 DEFB131AP59861 70 aa14.63□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.63□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 HILS1P60008 231 aa14.63□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FAM104AQ969W3 186 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 SPANXCQ9NY87 97 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 MTORP42345 2549 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FLNCQ14315 2725 aa14.62□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 LINC00158P58513 81 aa14.61□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 DCANP1Q8TF63 244 aa14.61□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.61□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 C9orf85Q96MD7 179 aa14.61□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.61□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 A0A0J9YX75 114 aa14.6□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.6□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.6□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 A0A087WYN8 130 aa14.59□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.59□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 LECT2O14960 151 aa14.59□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.59□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 CRPP02741 224 aa14.58□□□□□ -0.07
CDV3-201ENST00000264993 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.58□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 MALP21145 153 aa14.57□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 LINC00846Q9NV44 126 aa14.57□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 XCL2Q9UBD3 114 aa14.57□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.56□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.56□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.56□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 PAX4O43316 350 aa14.56□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 ACYP1P07311 99 aa14.55□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.55□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.55□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.54□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 LMO4P61968 165 aa14.53□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 LY6DQ14210 128 aa14.53□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 USP24Q9UPU5 2620 aa14.53□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.52□□□□□ -0.08
CDV3-201ENST00000264993 ATOX1O00244 68 aa14.52□□□□□ -0.09
CDV3-201ENST00000264993 NDUFA1O15239 70 aa14.51□□□□□ -0.09
CDV3-201ENST00000264993 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.51□□□□□ -0.09
CDV3-201ENST00000264993 USP17L23D6RBM5 183 aa14.51□□□□□ -0.09
CDV3-201ENST00000264993 OXTP01178 125 aa14.51□□□□□ -0.09
CDV3-201ENST00000264993 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms