RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	CETP	P11597	493 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	RHBDL3	P58872	404 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	SNAPC2	Q13487	334 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	IDI2	Q9BXS1	227 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB22	O15209	634 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	POLA2	Q14181	598 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	CPA4	Q9UI42	421 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	PPAT	Q06203	517 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-231	ENST00000600201	TLR2	O60603	784 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ENTPD3	O75355	529 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	PDHX	O00330	501 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SSH3	Q8TE77	659 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ARMC5	Q96C12	935 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	HOOK2	Q96ED9	719 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	CYP2C8	P10632	490 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP8B2	P98198	1209 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	TNNI3K	Q59H18	835 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	GORAB	Q5T7V8	394 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	C17orf99	Q6UX52	265 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	MYH1	P12882	1939 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	PANK1	Q8TE04	598 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF333	Q96JL9	665 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPRA	P18433	802 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	MAP3K10	Q02779	954 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC34A2	O95436	690 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIM47	Q96LD4	638 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZAP70	P43403	619 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	JAG1	P78504	1218 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	CEP85	Q6P2H3	762 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIM75P	A6NK02	468 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	BCR	P11274	1271 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	OSBP	P22059	807 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PSMC4	P43686	418 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	MTFR1	Q15390	333 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	TREML2	Q5T2D2	321 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-231	ENST00000600201	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51

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