RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	GRIK5	Q16478	980 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CIAO1	O76071	339 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.92	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CRK	P46108	304 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	BCAM	P50895	628 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	RASA3	Q14644	834 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SPRYD7	Q5W111	196 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	LPIN2	Q92539	896 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	VEZT	Q9HBM0	779 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SLC5A1	P13866	664 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	TNFAIP1	Q13829	316 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	PRKG1	Q13976	671 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	FZD1	Q9UP38	647 aa		7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	RGS19	P49795	217 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	MRE11	P49959	708 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	SREBF2	Q12772	1141 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	WNK4	Q96J92	1243 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	MEIS3	Q99687	375 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.9	□□□□□ -1.14
FGD4-215	ENST00000551984	MAST3	O60307	1309 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	MTX1	Q13505	466 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TEKT1	Q969V4	418 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	GNAI3	P08754	354 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	GJA5	P36382	358 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TNNI2	P48788	182 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	INHBE	P58166	350 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ATP2B3	Q16720	1220 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	SIL1	Q9H173	461 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	HCST	Q9UBK5	93 aa		7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM27	P14373	513 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	BECN1	Q14457	450 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	GPR25	O00155	361 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	SEMA3E	O15041	775 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	BCAR3	O75815	825 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	DSG2	Q14126	1118 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.88	□□□□□ -1.15

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