RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BCORQ6W2J9 1755 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPHP1O15259 732 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNQ4P56696 695 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP8B2P98198 1209 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PARP10Q53GL7 1025 aa6.92□□□□□ -1.3
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF20Q5VTR2 975 aa6.92□□□□□ -1.3
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8N3U1 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SVOPQ8N4V2 548 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.92□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPFIA3O75145 1194 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV5-2P06315 115 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPTP24298 496 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP85Q6P2H3 762 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNPY4Q8N129 248 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NARFQ9UHQ1 456 aa6.91□□□□□ -1.3
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UTYO14607 1347 aa6.91□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRGAP3O43295 1099 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHDP01880 384 aa6.9□□□□□ -1.3
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSFA2P28290 1259 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLFQ16534 295 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE3BQ5TA77 95 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETDB2Q96T68 719 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NYXQ9GZU5 481 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.9□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H7C1W4 665 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMTA2O94983 1202 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPP2O95045 317 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRD1O95696 1058 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOX11P35716 441 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBLBQ13191 982 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STK32BQ9NY57 414 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.9□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C4AP0C0L4 1744 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM177BA6PVY3 158 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB11FIP3O75154 756 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZVU0 165 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NLRP10Q86W26 655 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUCLG2Q96I99 432 aa6.89□□□□□ -1.31
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCTPP1Q9H773 170 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCN7AQ01118 1682 aa6.89□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SOBPA7XYQ1 873 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDE8AO60658 829 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNA1Q09470 495 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC57Q2TAC2 916 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMC5Q8IY18 1101 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SSH3Q8TE77 659 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CYLDQ9NQC7 956 aa6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.87□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAN1A2O60476 641 aa6.87□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LILRA1O75019 489 aa6.87□□□□□ -1.31
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BMP2P12643 396 aa6.87□□□□□ -1.31
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