RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PRAME-208ENST00000438888 ATP8B2P98198 1209 aa15.28■□□□□ 0.04
PRAME-208ENST00000438888 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PRAME-208ENST00000438888 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.28■□□□□ 0.04
PRAME-208ENST00000438888 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PRAME-208ENST00000438888 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.26■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 TFCP2Q12800 502 aa15.24■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.24■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 SRRDQ9UH36 339 aa15.23■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 ENTPD3O75355 529 aa15.22■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.22■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.21■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 CXCL11O14625 94 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 PRMT2P55345 433 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 PRKCZQ05513 592 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 GORABQ5T7V8 394 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 PI16Q6UXB8 463 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 SLF2Q8IX21 1173 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 DCTPP1Q9H773 170 aa15.21■□□□□ 0.03
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PRAME-208ENST00000438888 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 DOCK2Q92608 1830 aa15.21■□□□□ 0.03
PRAME-208ENST00000438888 TRIM75PA6NK02 468 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 FAM196BA6NMK8 535 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 PTPRAP18433 802 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 HOXD10P28358 340 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 GRK4P32298 578 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 FCGRTP55899 365 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 MECOMQ03112 1051 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 SMC5Q8IY18 1101 aa15.2■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.19■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.19■□□□□ 0.02
PRAME-208ENST00000438888 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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