RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 NHSQ6T4R5 1651 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ADH1AP07327 375 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 MAP2K3P46734 347 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 DOC2BQ14184 412 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 HLFQ16534 295 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ARTNQ5T4W7 220 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP10Q86W26 655 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KIF2CQ99661 725 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 RRAGCQ9HB90 399 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GPR108Q9NPR9 543 aa7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CIAO1O76071 339 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CAMTA2O94983 1202 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 RHOQP17081 205 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CHMLP26374 656 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PTGIRP43119 386 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 AK7Q96M32 723 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 USP26Q9BXU7 913 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.35□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ERC2O15083 957 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CASC1Q6TDU7 716 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TICAM2Q86XR7 235 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 SNX21Q969T3 373 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.34□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 EYA2O00167 538 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3R2O00459 728 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 REC8O95072 547 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 PARP10Q53GL7 1025 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 TNNI3KQ59H18 835 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 AACSQ86V21 672 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 GPATCH3Q96I76 525 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 SNRKQ9NRH2 765 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 RTL9Q8NET4 1388 aa7.33□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 BTAF1O14981 1849 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 NUP98P52948 1817 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 LRP5O75197 1615 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 GNB5O14775 395 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 SGSM2O43147 1006 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 PDE8AO60658 829 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 RPS6KA4O75676 772 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5JP18859 108 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 TFCP2Q12800 502 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 BECN1Q14457 450 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 CNTROBQ8N137 903 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 IL27Q8NEV9 243 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 EVI5LQ96CN4 794 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 FAM89AQ96GI7 184 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 SIL1Q9H173 461 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 BCORQ6W2J9 1755 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 LY75O60449 1722 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.32□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF609O15014 1411 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 NTSR2O95665 410 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 GPTP24298 496 aa7.31□□□□□ -1.24
C6orf48-208ENST00000395788 CTSWP56202 376 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.1 ms