RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.99■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 ZNF384Q8TF68 577 aa27.99■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 PDHXO00330 501 aa27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 POLA2Q14181 598 aa27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.98■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 MCAMP43121 646 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 RHBDL3P58872 404 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 GSTO1P78417 241 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 MAP3K10Q02779 954 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 MOGSQ13724 837 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 PICK1Q9NRD5 415 aa27.97■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 CXCL11O14625 94 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 LDHCP07864 332 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 ATP8B2P98198 1209 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 C17orf99Q6UX52 265 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 SSH3Q8TE77 659 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 RAI14Q9P0K7 980 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 CPA4Q9UI42 421 aa27.96■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa27.95■■■□□ 2.07
CLTB-202ENST00000345807 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.95■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 GPR108Q9NPR9 543 aa27.95■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ZHX2Q9Y6X8 837 aa27.95■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 SLURP2P0DP57 97 aa27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 PTPRAP18433 802 aa27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ZNF333Q96JL9 665 aa27.94■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 TNNI3KQ59H18 835 aa27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 NBPF11Q86T75 865 aa27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.93■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 GNRH1P01148 92 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 RLBP1P12271 317 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 CENPFP49454 3210 aa27.92■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 SLC34A2O95436 690 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 TMEM106CQ9BVX2 250 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 SNRKQ9NRH2 765 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.91■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 DOCK1Q14185 1865 aa27.9■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 TBC1D12O60347 775 aa27.89■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 PRMT2P55345 433 aa27.89■■■□□ 2.06
CLTB-202ENST00000345807 CYP2C8P10632 490 aa27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 CTGFP29279 349 aa27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 PSMC4P43686 418 aa27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 TEX11Q8IYF3 940 aa27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 TRIM47Q96LD4 638 aa27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 FAM196BA6NMK8 535 aa27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 SRRDQ9UH36 339 aa27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.86■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 TRIM75PA6NK02 468 aa27.85■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.85■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 BAG3O95817 575 aa27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 MYCP01106 439 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 BCRP11274 1271 aa27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 HOXD10P28358 340 aa27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CLTB-202ENST00000345807 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms