RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA5Q8NB90 893 aa22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MBD4O95243 580 aa22.39■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 SLC51AQ86UW1 340 aa22.39■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CERS3Q8IU89 383 aa22.39■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.39■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
ZNF554-201ENST00000317243 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.39■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 LPIN2Q92539 896 aa22.39■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.39■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 A0A1B0GVL5 298 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CDC27P30260 824 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 MICU3Q86XE3 530 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 AIDAQ96BJ3 306 aa22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.37■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.37■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 C8orf76Q96K31 380 aa22.37■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 SMC2O95347 1197 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 NTSR2O95665 410 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 LCORLQ8N3X6 602 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 BIN1O00499 593 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CPLX1O14810 134 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 EVCP57679 992 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ST5P78524 1137 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC93Q567U6 631 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 GYG1P46976 350 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 CHRNDQ07001 517 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 UBE3CQ15386 1083 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ERFEQ4G0M1 354 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 TEX35Q5T0J7 233 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 NBPF11Q86T75 865 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 SLC5A1P13866 664 aa22.33■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 NDUFA8P51970 172 aa22.33■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.17
ZNF554-201ENST00000317243 TRDNQ13061 729 aa22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ISM2Q6H9L7 571 aa22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 TMC6Q7Z403 805 aa22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 EVX2Q03828 476 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 SMARCE1Q969G3 411 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 KCND1Q9NSA2 647 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 IFNKQ9P0W0 207 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ABCF2Q9UG63 623 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 UBXN4Q92575 508 aa22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 GSDMDP57764 484 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 APOA5Q6Q788 366 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 HOMER1Q86YM7 354 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ABCC12Q96J65 1359 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 KLRK1P26718 216 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB9Q96C00 473 aa22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.3■■□□□ 1.16
ZNF554-201ENST00000317243 STK38Q15208 465 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms