RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-210ENST00000551525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 TSPY4P0CV99 314 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 TSPY10P0CW01 314 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHG5O94827 1062 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 PTMSP20962 102 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 NEFMP07197 916 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-210ENST00000551525 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 P3H3Q8IVL6 736 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 CUX2O14529 1486 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JS52 829 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 CLIP1P30622 1438 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL34Q8N239 644 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRB-210ENST00000551525 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 ARID3CA6NKF2 412 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 SOGA1O94964 1423 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 NEUROD1Q13562 356 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 KCNH8Q96L42 1107 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA3Q08378 1498 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 KANK1Q14678 1352 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 NCAPD3P42695 1498 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO3Q9UK99 471 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCA4P51532 1647 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 APPP05067 770 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRB-210ENST00000551525 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 MLECQ14165 292 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 NBR1Q14596 966 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 POGZQ7Z3K3 1410 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 CEP162Q5TB80 1403 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 HMGXB3Q12766 1538 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 FMN1Q68DA7 1419 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 IFT140Q96RY7 1462 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 CDCA8Q53HL2 280 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-210ENST00000551525 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 EID1Q9Y6B2 187 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 TONSLQ96HA7 1378 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 JPH4Q96JJ6 628 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRGP23470 1445 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 TOM1O60784 492 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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