RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 RASEFQ8IZ41 740 aa12.88□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 KLHL34Q8N239 644 aa12.87□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 NUBP1P53384 320 aa12.84□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.84□□□□□ -0.35
RNU6-491P-201ENST00000516099 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RNU6-491P-201ENST00000516099 PLEKHG5O94827 1062 aa12.82□□□□□ -0.36
RNU6-491P-201ENST00000516099 CLCN6P51797 869 aa12.82□□□□□ -0.36
RNU6-491P-201ENST00000516099 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPOCK2Q92563 424 aa12.81□□□□□ -0.36
RNU6-491P-201ENST00000516099 KIF12Q96FN5 646 aa12.73□□□□□ -0.37
RNU6-491P-201ENST00000516099 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.73□□□□□ -0.37
RNU6-491P-201ENST00000516099 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RNU6-491P-201ENST00000516099 MAP3K13O43283 966 aa12.67□□□□□ -0.38
RNU6-491P-201ENST00000516099 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.66□□□□□ -0.38
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRPC6Q9Y210 931 aa12.65□□□□□ -0.38
RNU6-491P-201ENST00000516099 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RNU6-491P-201ENST00000516099 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RNU6-491P-201ENST00000516099 RGL2O15211 777 aa12.59□□□□□ -0.39
RNU6-491P-201ENST00000516099 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM212AQ96EL1 285 aa12.58□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.57□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.56□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 LHX8Q68G74 356 aa12.54□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 CFAP44Q96MT7 982 aa12.54□□□□□ -0.4
RNU6-491P-201ENST00000516099 IFNL1Q8IU54 200 aa12.52□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.52□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 PYGBP11216 843 aa12.51□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.51□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 POTEB2H3BUK9 544 aa12.5□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 BCANQ96GW7 911 aa12.49□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 TIE1P35590 1138 aa12.46□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.46□□□□□ -0.41
RNU6-491P-201ENST00000516099 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.45□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 GSE1Q14687 1217 aa12.43□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 POTEFA5A3E0 1075 aa12.42□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.41□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.41□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RNU6-491P-201ENST00000516099 POTEJP0CG39 1038 aa12.39□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 METRNQ9UJH8 293 aa12.39□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 C7P10643 843 aa12.37□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLC39A7Q92504 469 aa12.37□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.36□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.34□□□□□ -0.43
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRIM41Q8WV44 630 aa12.33□□□□□ -0.44
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.33□□□□□ -0.44
RNU6-491P-201ENST00000516099 OTUD5Q96G74 571 aa12.32□□□□□ -0.44
RNU6-491P-201ENST00000516099 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
RNU6-491P-201ENST00000516099 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.31□□□□□ -0.44
RNU6-491P-201ENST00000516099 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
RNU6-491P-201ENST00000516099 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.26□□□□□ -0.45
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RNU6-491P-201ENST00000516099 IER5LQ5T953 404 aa12.23□□□□□ -0.45
RNU6-491P-201ENST00000516099 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RNU6-491P-201ENST00000516099 PSEN1P49768 467 aa12.2□□□□□ -0.46
RNU6-491P-201ENST00000516099 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.18□□□□□ -0.46
RNU6-491P-201ENST00000516099 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEC24BO95487 1268 aa12.15□□□□□ -0.46
RNU6-491P-201ENST00000516099 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.13□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 STK25O00506 426 aa12.09□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 OCEL1Q9H607 264 aa12.09□□□□□ -0.47
RNU6-491P-201ENST00000516099 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 PLCG2P16885 1265 aa12.06□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.05□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 CABP2Q9NPB3 220 aa12.05□□□□□ -0.48
RNU6-491P-201ENST00000516099 NBR1Q14596 966 aa12.02□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.01□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 STK24Q9Y6E0 443 aa12□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.98□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 GOLGA2Q08379 1002 aa11.97□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RNU6-491P-201ENST00000516099 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-491P-201ENST00000516099 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.88□□□□□ -0.51
RNU6-491P-201ENST00000516099 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RNU6-491P-201ENST00000516099 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RNU6-491P-201ENST00000516099 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.84□□□□□ -0.51
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOX12O15370 315 aa11.83□□□□□ -0.52
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms