RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.26■□□□□ 0.99
RXRA-201ENST00000356384 BECN1Q14457 450 aa21.23■□□□□ 0.99
RXRA-201ENST00000356384 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RXRA-201ENST00000356384 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.19■□□□□ 0.98
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.18■□□□□ 0.98
RXRA-201ENST00000356384 C14orf37Q86TY3 774 aa21.16■□□□□ 0.98
RXRA-201ENST00000356384 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.16■□□□□ 0.98
RXRA-201ENST00000356384 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
RXRA-201ENST00000356384 MIER1Q8N108 512 aa21.13■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 TSPY4P0CV99 314 aa21.13■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 TSPY10P0CW01 314 aa21.13■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.12■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
RXRA-201ENST00000356384 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.07■□□□□ 0.96
RXRA-201ENST00000356384 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.06■□□□□ 0.96
RXRA-201ENST00000356384 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 13.9
RXRA-201ENST00000356384 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 KCNH8Q96L42 1107 aa21■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 CASC1Q6TDU7 716 aa21■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.97■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.96■□□□□ 0.95
RXRA-201ENST00000356384 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.95■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 PLCB2Q00722 1185 aa20.95■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 CFAP53Q96M91 514 aa20.94■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.92■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 RGL3Q3MIN7 710 aa20.91■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
RXRA-201ENST00000356384 NEUROD2Q15784 382 aa20.89■□□□□ 0.93
RXRA-201ENST00000356384 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RXRA-201ENST00000356384 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.86■□□□□ 0.93
RXRA-201ENST00000356384 RGS3P49796 1198 aa20.85■□□□□ 0.93
RXRA-201ENST00000356384 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.84■□□□□ 0.93
RXRA-201ENST00000356384 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.8■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.79■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 FGD1P98174 961 aa20.79■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 CDCA8Q53HL2 280 aa20.77■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RXRA-201ENST00000356384 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 NPHP1O15259 732 aa20.75■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.75■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 KCNJ4P48050 445 aa20.73■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.73■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 NUDCQ9Y266 331 aa20.72■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 NRDCO43847 1150 aa20.71■□□□□ 0.91
RXRA-201ENST00000356384 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.7■□□□□ 0.9
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.68■□□□□ 0.9
RXRA-201ENST00000356384 CLIP1P30622 1438 aa20.67■□□□□ 0.9
RXRA-201ENST00000356384 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.66■□□□□ 0.9
RXRA-201ENST00000356384 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.64■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 POGKQ9P215 609 aa20.64■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA2Q08379 1002 aa20.63■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 CLSTN1O94985 981 aa20.62■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 HSCBQ8IWL3 235 aa20.61■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.61■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.6■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.6■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 MS4A1P11836 297 aa20.59■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 DRC7Q8IY82 874 aa20.58■□□□□ 0.89
RXRA-201ENST00000356384 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RXRA-201ENST00000356384 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RXRA-201ENST00000356384 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.879e-6■■■■■ 50.1
RXRA-201ENST00000356384 MCCP23508 829 aa20.51■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 MLECQ14165 292 aa20.49■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.49■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 SOX12O15370 315 aa20.48■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RXRA-201ENST00000356384 APBB1O00213 710 aa20.43■□□□□ 0.86
RXRA-201ENST00000356384 ARID3AQ99856 593 aa20.41■□□□□ 0.86
RXRA-201ENST00000356384 WIZO95785 1651 aa20.4■□□□□ 0.86
RXRA-201ENST00000356384 TMF1P82094 1093 aa20.4■□□□□ 0.86
RXRA-201ENST00000356384 CEP162Q5TB80 1403 aa20.39■□□□□ 0.85
RXRA-201ENST00000356384 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms