RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613013.1

UBXN8-206, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN8, Length 528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-206ENST00000613013 H7C1H1 209 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 PCP2Q8IVA1 136 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 IL17DQ8TAD2 202 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 PEMTQ9UBM1 199 aa6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 CBY3A6NI87 242 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 F8VRH5 84 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 VCYO14598 125 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 CRYGDP07320 174 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 MGPP08493 103 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 PLNP26678 52 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 ERASQ7Z444 233 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 PTH2Q96A98 100 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 CSTL1Q9H114 145 aa6.65□□□□□ -1.34
UBXN8-206ENST00000613013 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 H3BRM9 83 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 CCL25O15444 150 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 Q6ZVH6 145 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 JPT2Q9H910 190 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 MDFICQ9P1T7 246 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 A6NDN8 102 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 H3BMM0 161 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 M0QY20 66 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 NMUP48645 174 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 PTTG1IPP53801 180 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TAL2Q16559 108 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 OR11H1Q8NG94 326 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 BAALCQ8WXS3 180 aa6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 IGIPA6NJ69 53 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DEFB131AP59861 70 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 RHOHQ15669 191 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TMEM141Q96I45 108 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TIMM17AQ99595 171 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.62□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 A0A087WWL8 130 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 C9orf118A6NHY6 69 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TSHBP01222 138 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 IGKV3-20P01619 116 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DEFB136Q30KP8 78 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 KIR2DL4Q99706 377 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TM2D2Q9BX73 214 aa6.61□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 KNCNA6PVL3 124 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 E9PLD3 99 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 F5H697 171 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 FHL3Q13643 280 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.6□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 K7EP13 123 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 PMVKQ15126 192 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 VAMP3Q15836 100 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 ZNF876PQ49A33 203 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.59□□□□□ -1.35
UBXN8-206ENST00000613013 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-206ENST00000613013 A8MWV9 139 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-206ENST00000613013 I3L3M4 83 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-206ENST00000613013 M0R2P5 195 aa6.58□□□□□ -1.36
UBXN8-206ENST00000613013 P0DMU3 169 aa6.58□□□□□ -1.36
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