RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523062.1

CSMD1-211, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 1, human

TSL 3

Gene CSMD1, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD1-211	ENST00000523062	DPM2	O94777	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TSHB	P01222	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		F8VRH5	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		M0R143	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	IGKC	P01834	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		P0DMU3	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	PLN	P26678	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	APOC4	P55056	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		Q6ZTI0	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062		K7EQD1	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	COX8A	P10176	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CTAG1A	P78358	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062		Q6ZSN1	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CUBN	O60494	3623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE7	O76087	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	COTL1	Q14019	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	STPG4	Q8N801	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	NPS	P0C0P6	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PMVK	Q15126	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062		X6R8D5	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	DLEU1	O43261	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	FGF6	P10767	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	NMU	P48645	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CRYBA4	P53673	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	EMP1	P54849	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	ATR	Q13535	2644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	TCTA	P57738	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	UBE2D3	P61077	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	HERVK_113	P61574	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	UBE2D2	P62837	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE1	Q13065	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD1-211	ENST00000523062	GAGE4	Q13068	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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