RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512274.1

PDLIM5-217, Transcript of PDZ and LIM domain 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDLIM5, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5-217ENST00000512274 DNAH2Q9P225 4427 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 NACAE9PAV3 2078 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 PRM2P04554 102 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 NPSP0C0P6 89 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.36□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 C12orf57Q99622 126 aa7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.35□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 C3orf79P0CE67 100 aa7.35□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 Q8NAQ8 132 aa7.35□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 OR11H2Q8NH07 326 aa7.35□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 KIR2DL4Q99706 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 I3L3M4 83 aa7.34□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 ATP5LO75964 103 aa7.34□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 PMCHL1Q16048 86 aa7.34□□□□□ -1.23
PDLIM5-217ENST00000512274 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.34□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.34□□□□□ -1.23
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PDLIM5-217ENST00000512274 SCGB1D1O95968 90 aa7.3□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 NUDT3O95989 172 aa7.3□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 TSHBP01222 138 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDLIM5-217ENST00000512274 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.29□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.29□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.29□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.29□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 EMP1P54849 157 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDLIM5-217ENST00000512274 PRO0255Q9UI72 69 aa7.28□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDLIM5-217ENST00000512274 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.27□□□□□ -1.25
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