RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476986.1

IFT52-208, Transcript of intraflagellar transport 52, human

TSL 5

Gene IFT52, Length 307 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT52-208	ENST00000476986	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	SH2D1A	O60880	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	LAGE3	Q14657	143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	COX19	Q49B96	90 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986		M0R2Z0	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	PHOX2A	O14813	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	SPINK4	O60575	86 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	S100A6	P06703	90 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FRZB	Q92765	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HERC1	Q15751	4861 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	MT-ND6	P03923	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	GZMB	P10144	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	AZU1	P20160	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	CCL18	P55774	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986		Q6AWC8	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IFT52-208	ENST00000476986	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986		A0A0J9YX75	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986		A0A0J9YY99	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986		A0A1B0GXF2	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	ORM1	P02763	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	CRISP2	P16562	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	RAB4B	P61018	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986		A0A1B0GUT8	65 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	S100A8	P05109	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	GPX1	P07203	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	LEP	P41159	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	NDUFA6	P56556	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	HBB	P68871	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	PRR9	Q5T870	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	LINC01587	Q99440	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986		A0A1B0GW15	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	KLLN	B2CW77	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	RS1	O15537	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	INS	P01308	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	APCS	P02743	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	ATP5G1	P05496	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IFT52-208	ENST00000476986	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms