RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 PRO0255Q9UI72 69 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 GPHB5Q86YW7 130 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 AJUBAQ96IF1 538 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB136Q30KP8 78 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 BLCAPP62952 87 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-202ENST00000400053 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 NCR3O14931 201 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 MBD6Q96DN6 1003 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 LRP4O75096 1905 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 KLK12Q9UKR0 248 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 MLST8Q9BVC4 326 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 SLURP1P55000 103 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N9W7 124 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 UQCRQO14949 82 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFC1O43677 76 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 FAM236CP0DP71 79 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 MDFICQ9P1T7 246 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 MIAQ16674 131 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 Q8NA96 180 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 H7C423 109 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 Q8N7P7 452 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 HIVEP2P31629 2446 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRM-202ENST00000400053 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 ESM1Q9NQ30 184 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 IGLC6P0CF74 106 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WW49 117 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YXY3 114 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB135Q30KP9 77 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 NFE4Q86UQ8 179 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 LYRM9A8MSI8 78 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ODF3Q96PU9 254 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CENPFP49454 3210 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 CRIP1P50238 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YX75 114 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRM-202ENST00000400053 Q8N9L7 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf33Q8WU49 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRM-202ENST00000400053 LINC00310P59036 64 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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