RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		C9JCJ5	164 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6G6D	O95868	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10J4	P0C629	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTFR	P26992	372 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYBB3	P26998	211 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A2	P29034	98 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RBX1	P62877	108 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF90	Q03938	601 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N976	141 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FRZB	Q92765	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRGV9	Q99603	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		3.36	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ODF3B	A8MYP8	253 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	OOSP1	A8MZH6	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TSTD3	H0UI37	97 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HYPM	O75409	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	APELA	P0DMC3	54 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG4	P50150	75 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TCTA	P57738	103 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HES1	Q14469	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PATE2	Q6UY27	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF492	Q9P255	531 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	BPY2	O14599	106 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PHOX2A	O14813	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LTA	P01374	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-69	P01742	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	APCS	P02743	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FXYD3	Q14802	87 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MMD	Q15546	238 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	NIT2	Q9NQR4	276 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.34	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		I3L2K1	104 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R381	172 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PYY	P10082	97 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	EBI3	Q14213	229 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PCP2	Q8IVA1	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	OSTC	Q9NRP0	149 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC17A3	O00476	420 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NPFF	O15130	113 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA3	O95167	84 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP4	P15090	132 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	CD24	P25063	80 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	BRS3	P32247	399 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	KLRD1	Q13241	179 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	BAGE2	Q86Y30	109 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	EPDR1	Q9UM22	224 aa		3.33	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	TNC	P24821	2201 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NDX4	124 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	KNCN	A6PVL3	124 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EIM0	57 aa		3.32	□□□□□ -1.88
EFHC1-223	ENST00000636616	PPBP	P02775	128 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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