RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592401.1

CEP89-208, Transcript of centrosomal protein 89, human

TSL 4

Gene CEP89, Length 558 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP89-208	ENST00000592401	RYR3	Q15413	4870 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	RYR2	Q92736	4967 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401		A0A096LNJ9	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	RHOD	O00212	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	LINC00614	P0C842	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	MIF	P14174	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401		Q9UF83	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEP89-208	ENST00000592401	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		P0DMU3	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FABP4	P15090	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	ZNF56	Q15929	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		Q8N8P6	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		F5H697	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	GAGE7	O76087	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	PPP1R17	O96001	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	EMP1	P54849	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FHL2	Q14192	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DEFB4A	O15263	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	CIDEA	O60543	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	HSBP1	O75506	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	PMCH	P20382	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	S100A2	P29034	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	AMT	P48728	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		H7C1H1	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		K7EMI3	77 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		K7EQD1	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TSHB	P01222	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		Q8N976	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		A0A0J9YWU9	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	VCY	O14598	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	TCAP	O15273	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	HBD	P02042	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	FCER1G	P30273	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	AKR1D1	P51857	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LAGE3	Q14657	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401		I3L3M4	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	UBE2D3	P61077	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	UBE2D2	P62837	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEP89-208	ENST00000592401	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms