RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 KIR2DL4Q99706 377 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 M0QY20 66 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC01549A6NIU2 74 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 NMUP48645 174 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 DLEU1O43261 78 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 INSP01308 110 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TCTAP57738 103 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF415Q09FC8 603 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ERASQ7Z444 233 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC01587Q99440 93 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 OR11H12B2RN74 326 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 H7C1H1 209 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 PLNP26678 52 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 STHQ8IWL8 128 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 CYSLTR1Q9Y271 337 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 M0R2P5 195 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 F8VRH5 84 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SIVA1O15304 175 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PCP2Q8IVA1 136 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PTH2Q96A98 100 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 A8MWV9 139 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 BAALCQ8WXS3 180 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PRM2P04554 102 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 STAB1Q9NY15 2570 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SPXQ9BT56 116 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 XCL2Q9UBD3 114 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPPLY3P57055 190 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOHQ15669 191 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM141Q96I45 108 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-211ENST00000539589 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 IGIPA6NJ69 53 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 I3L3M4 83 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TIMM17AQ99595 171 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE1Q13065 139 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 COX11Q9Y6N1 276 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TSHBP01222 138 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD52Q0P140 79 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 RHODO00212 210 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC11AP67812 179 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PMVKQ15126 192 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 HIGD1BQ9P298 99 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 INSL3P51460 131 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-211ENST00000539589 COL6A5A8TX70 2615 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 AZU1P20160 251 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZVH6 145 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CST9LQ9H4G1 147 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 P0DMU3 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM231AP0DMU4 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM231CP0DMU5 169 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TAX1BP3O14907 124 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RS1O15537 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms