RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TAX1BP3O14907 124 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 JMJD1CQ15652 2540 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SIVA1O15304 175 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SMR3AQ99954 134 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 M0R2P5 195 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TENM4Q6N022 2769 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 JMJD8Q96S16 334 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 P0DMU3 169 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM231AP0DMU4 169 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM231CP0DMU5 169 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PROK1P58294 105 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01549A6NIU2 74 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 UBE2V1Q13404 147 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 HIST1H4GQ99525 98 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MWV9 139 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 I3L3M4 83 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 HERVK_113P61574 105 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 PMVKQ15126 192 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BUT2 72 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CCL25O15444 150 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM141Q96I45 108 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EP13 123 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF815PA8K554 130 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM13P0DJ93 91 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 VCX2Q9H322 139 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf86A6NJI1 115 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 RHOHQ15669 191 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 SPXQ9BT56 116 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CST9LQ9H4G1 147 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 GAGE10A6NGK3 116 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 PF4P02776 101 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 IGIPA6NJ69 53 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-53P01767 116 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 FXYD2P54710 66 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TIMM17AQ99595 171 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 HIGD1BQ9P298 99 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 AZU1P20160 251 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 FHL3Q13643 280 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 H3BRM9 83 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 RIPPLY3P57055 190 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 HILS1P60008 231 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 RHODO00212 210 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 TSHBP01222 138 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 A8MTW9 85 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 C16orf95Q9H693 158 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 E9PLD3 99 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf118A6NHY6 69 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 K7ERJ3 54 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CEND1Q8N111 149 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 LY6G6DO95868 133 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 COTL1Q14019 142 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZSN1 163 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 Q9UF83 564 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.02□□□□□ -1.12
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0J9YXV3 536 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 FABP2P12104 132 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.02□□□□□ -1.13
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