RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 BCAP31P51572 246 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 VAMP2P63027 116 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 PPP1R1AQ13522 171 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 PSG8Q9UQ74 426 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 B4DEV8 164 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 CAMPP49913 170 aa7.57□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 FOXI1Q12951 378 aa7.57□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 ZFP82Q8N141 532 aa7.57□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 F5H697 171 aa7.56□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.55□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 SS18Q15532 418 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.55□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 S100A11P31949 105 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 KHDC3LQ587J8 217 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 DNLZQ5SXM8 178 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 PRNTQ86SH4 94 aa7.54□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 FAM168BA1KXE4 195 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 XCL1P47992 114 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-211ENST00000463372 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 AP3S1Q92572 193 aa7.53□□□□□ -1.2
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C9orf3-211ENST00000463372 HBG2P69892 147 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 RNF151Q2KHN1 245 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 MCFD2Q8NI22 146 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 M0R036 132 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R45P59539 299 aa7.51□□□□□ -1.21
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C9orf3-211ENST00000463372 M0QXV9 152 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 TCRAP04437 139 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 CFC1P0CG37 223 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 SULT1A1P50225 295 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 ATP6V1FQ16864 119 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 MED28Q9H204 178 aa7.49□□□□□ -1.21
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C9orf3-211ENST00000463372 NCS1P62166 190 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 IL18Q14116 193 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 STX12Q86Y82 276 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 THAP6Q8TBB0 222 aa7.48□□□□□ -1.21
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C9orf3-211ENST00000463372 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-211ENST00000463372 CCL25O15444 150 aa7.47□□□□□ -1.21
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C9orf3-211ENST00000463372 RGS5O15539 181 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 A6NHS1 94 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 NUPR1O60356 82 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM17P0DL12 118 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 MALP21145 153 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 VCX3BQ9H321 246 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00846Q9NV44 126 aa7.44□□□□□ -1.22
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