RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 JPT2Q9H910 190 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 GAS8-AS1O95177 125 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-53P01767 116 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 PYY3Q5JQD4 70 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf57Q99622 126 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DL4Q99706 377 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.04□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LYRM9A8MSI8 78 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 MIFP14174 115 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 PET117Q6UWS5 81 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 RNF183Q96D59 192 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf202A1L168 122 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 ATP5LO75964 103 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 PRM2P04554 102 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf79P0CE67 100 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-11P60412 298 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 S100A12P80511 92 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 RHOHQ15669 191 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 PMCHL1Q16048 86 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 MRAPQ8TCY5 172 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 X6R8D5 127 aa7.02□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 A0A096LNJ9 63 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 I3L3M4 83 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB1D1O95968 90 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 KRTDAPP60985 99 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.01□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 NUDT3O95989 172 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZTI0 123 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 OR11H2Q8NH07 326 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TOMM6Q96B49 74 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 RYR2Q92736 4967 aa7□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 G3V4G9 280 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 COL7A1Q02388 2944 aa6.99□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12BA1L429 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 K7EQD1 137 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE7O76087 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 NPSP0C0P6 89 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12FP0CL80 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12GP0CL81 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 GAGE12IP0CL82 117 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB135Q30KP9 77 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01545Q5VT33 79 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N976 141 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF479Q96JC4 524 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 ERASQ7Z444 233 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 Q8NAQ8 132 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM141Q96I45 108 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 ZMAT4Q9H898 229 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 CRYBA4P53673 196 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZSN1 163 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM17AQ99595 171 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-202ENST00000409024 DKK2Q9UBU2 259 aa6.96□□□□□ -1.3
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