RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 IFITM1P13164 125 aa14.88□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 PSMB8P28062 276 aa14.88□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 C11orf86A6NJI1 115 aa14.88□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 ODF3Q96PU9 254 aa14.87□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 J3QLI3 93 aa14.87□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 ITPR1Q14643 2758 aa14.87□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 ZNF688P0C7X2 276 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 DCANP1Q8TF63 244 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 AVPP01185 164 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 CRYGDP07320 174 aa14.86□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.85□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 TSHBP01222 138 aa14.85□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 C5orf47Q569G3 176 aa14.85□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 SNCGO76070 127 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 CD7P09564 240 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 TEN1Q86WV5 123 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 ZANQ9Y493 2812 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.84□□□□□ -0.03
PAN3-201ENST00000380958 POLQO75417 2590 aa14.83□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 FLNCQ14315 2725 aa14.82□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.82□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 A0A087WW49 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.81□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.81□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.81□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 A4D1N5 150 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 IGHV4-59P01825 116 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 CACNA1AO00555 2505 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 H7C2G1 150 aa14.8□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.79□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 COX6B1P14854 86 aa14.79□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 LINC00315P59091 139 aa14.79□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 NRGNQ92686 78 aa14.79□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 LINC01619G3V211 115 aa14.78□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 LGALS9O00182 355 aa14.78□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 ZNF56Q15929 161 aa14.78□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.78□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 MDFICQ9P1T7 246 aa14.78□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 A0A096LNT2 108 aa14.77□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 LINC00694P0DN24 101 aa14.77□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 HTN1P15515 57 aa14.77□□□□□ -0.04
PAN3-201ENST00000380958 A0A0J9YY99 117 aa14.77□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 PMVKQ15126 192 aa14.77□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 IGIPA6NJ69 53 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 A0A0J9YX75 114 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 ELANEP08246 267 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 HERVK_113P61574 105 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.76□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.75□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TMEM262E9PQX1 116 aa14.75□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 K7EQG2 157 aa14.75□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 UBE2D1P51668 147 aa14.75□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 VCX2Q9H322 139 aa14.75□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 C9orf85Q96MD7 179 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 A8MWV9 139 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 VCYO14598 125 aa14.74□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TCL1BO95988 128 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 CFC1BP0CG36 223 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 CFC1P0CG37 223 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 RNF152Q8N8N0 203 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 MYO9AB2RTY4 2548 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 DUX5Q96PT3 197 aa14.73□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.72□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.72□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.72□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.72□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 FSHBP01225 129 aa14.71□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TMEM141Q96I45 108 aa14.71□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.71□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PAN3-201ENST00000380958 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.7□□□□□ -0.06
PAN3-201ENST00000380958 J3QQQ9 107 aa14.7□□□□□ -0.06
PAN3-201ENST00000380958 Q6YL49 198 aa14.7□□□□□ -0.06
PAN3-201ENST00000380958 LINC01587Q99440 93 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.6 ms