RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.82□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 K7EMI3 77 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RRN3P1Q2M238 152 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 VCYO14598 125 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 COX8AP10176 69 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 ODF1Q14990 250 aa9.81□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R17O96001 155 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB4AO15263 64 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB130BP0DP73 79 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 DEFB130AP0DP74 79 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 FHL3Q13643 280 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 C20orf78Q9BR46 151 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.79□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 ZNF415Q09FC8 603 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 NPSP0C0P6 89 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 OR11H2Q8NH07 326 aa9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12BA1L429 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE7O76087 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12FP0CL80 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12GP0CL81 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 GAGE12IP0CL82 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AZU1P20160 251 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 H7C1H1 209 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 HTN3P15516 51 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AMTNQ6UX39 209 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.77□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGLV1-51P01701 117 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 A0A087WX48 190 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 HIST1H4GQ99525 98 aa9.76□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 MED14OSP0DP75 135 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 DEFB135Q30KP9 77 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 K7EP13 123 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CRYGDP07320 174 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.75□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 Q9UF83 564 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AKAP9Q99996 3911 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 F8VRH5 84 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 M0R2P5 195 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 BAALCQ8WXS3 180 aa9.74□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 DLEU1O43261 78 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 C9orf85Q96MD7 179 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 VCX2Q9H322 139 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 M0QY20 66 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 PLNP26678 52 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 TOMM6Q96B49 74 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ODF3Q96PU9 254 aa9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 SFTA2Q6UW10 78 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 A6NDN8 102 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 H3BUT2 72 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 LINC00315P59091 139 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZTI0 123 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.72□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ZNF815PA8K554 130 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 I3L3M4 83 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
HCN3-201ENST00000368358 COX11Q9Y6N1 276 aa9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1635.9 ms