RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 THBDP07204 575 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PSMG4Q5JS54 123 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PIP4P1Q86T03 277 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 A4D1N5 150 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PRAC2D3DTV9 90 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ASIPP42127 132 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YY99 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RNF125Q96EQ8 232 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 RNF182Q8N6D2 247 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 NRACQ8N912 160 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf86A6NJI1 115 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 H3BRN7 92 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 PRB1P04280 392 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 HERVK_113P61574 105 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf47Q569G3 176 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 MDFICQ9P1T7 246 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM23O14925 209 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 HES1Q14469 280 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01620Q4KN68 170 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 Q8NA96 180 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 BAALCQ8WXS3 180 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-30P01768 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 NPC2P61916 151 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZSV7 163 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 NUP37Q8NFH4 326 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 H3BMM0 161 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 COX6B1P14854 86 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 PMVKQ15126 192 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2WQ96B02 151 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 RBAKDNA6NC62 111 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 NPFFO15130 113 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 RS1O15537 224 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 HERVK_113P63121 156 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf82Q6UX34 121 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 M0R381 172 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 I3L2K1 104 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-33P01772 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 MGPP08493 103 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC2BQ92478 149 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01546A6NGU7 62 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01619G3V211 115 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TIMD4Q96H15 378 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP9Q99996 3911 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TEX22C9J3V5 150 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 E7EQL1 145 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 LGALS9O00182 355 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 Q6Q795 121 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM126AQ9H061 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 K7EIM0 57 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 CD3EP07766 207 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00311Q8N616 119 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF580Q9UK33 172 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TENM4Q6N022 2769 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-211ENST00000618610 TRIAP1O43715 76 aa6.23□□□□□ -1.41
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