RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547519.1

HECTD4-205, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-205	ENST00000547519	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	COX7A2L	O14548	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	RMI2	Q96E14	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		Q9Y3F1	56 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		F6UB75	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		M0R381	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	LEPROT	O15243	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	SH2D1A	O60880	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		M0R3E3	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	STATH	P02808	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CD28	P10747	220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	FOLR3	P41439	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CXCL6	P80162	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL4	P13236	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	UBE2A	P49459	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	HTT	P42858	3142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		A0A087WZ39	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CRIP1	P50238	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	XP32	Q5T750	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL13	Q99616	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	POLE	Q07864	2286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		M0R1W7	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		Q6ZRP5	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		Q6ZTC4	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TFF2	Q03403	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	LITAF	Q99732	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HECTD4-205	ENST00000547519		A0A0J9YXY3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	KLLN	B2CW77	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00205	P59089	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LHB	P01229	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00313	P59037	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	MIA	Q16674	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519		Q8N6K4	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	MP68	P56378	58 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	BRCA2	P51587	3418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HECTD4-205	ENST00000547519		A0A0A0MQY5	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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