RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 PLAC8Q9NZF1 115 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PPV4 95 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 RANP62826 216 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 KCNS1Q96KK3 526 aa14.67□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 PARLQ9H300 379 aa14.67□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 FSIP2Q5CZC0 6907 aa14.67□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 SMLR1H3BR10 107 aa14.66□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM262E9PQX1 116 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 ARPC5O15511 151 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 MBP02144 154 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 STAG3L2P0CL84 134 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 STAG3L3P0CL85 134 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 RAB24Q969Q5 203 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 LINC00479Q96M42 142 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.65□□□□□ -0.06
PRDM4-202ENST00000547188 TAAR5O14804 337 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 SUN5Q8TC36 379 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 C9orf85Q96MD7 179 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 OTORQ9NRC9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 TVP23CQ96ET8 276 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 HMSDA8MTL9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF345Q14585 488 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 JPT2Q9H910 190 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 GCHFRP30047 84 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 MPV17L2Q567V2 206 aa14.6□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 hDV102S1A0JD36 115 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 SLPIP03973 132 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF726P1Q15940 193 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 TMED6Q8WW62 240 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 HYLS1Q96M11 299 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 TREM1Q9NP99 234 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 VAX2Q9UIW0 290 aa14.59□□□□□ -0.07
PRDM4-202ENST00000547188 H7C1H1 209 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 PTH2Q96A98 100 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CRCT1Q9UGL9 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CXorf1O96002 111 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 MIAQ16674 131 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.57□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.56□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 Q6ZNX1 250 aa14.56□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 A0A087WWL8 130 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 A8MWV9 139 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 MAJINQ3KP22 176 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.55□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.54□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 GNG5P63218 68 aa14.53□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.53□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.53□□□□□ -0.08
PRDM4-202ENST00000547188 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.52□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 COX6A2Q02221 97 aa14.52□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 STPG4Q8N801 248 aa14.52□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PRE2 83 aa14.51□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 BCL2L11O43521 198 aa14.51□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 TCRAP04437 139 aa14.51□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 SGK494Q96LW2 274 aa14.51□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.51□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 FAM231BA6NCW3 169 aa14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 PRR4Q16378 134 aa14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 EPDR1Q9UM22 224 aa14.5□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 TMUB2Q71RG4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.48□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.48□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 FHITP49789 147 aa14.48□□□□□ -0.09
PRDM4-202ENST00000547188 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.48□□□□□ -0.09
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