RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WWL8 130 aa12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 HILS1P60008 231 aa12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 HIVEP2P31629 2446 aa12.36□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 BATFQ16520 125 aa12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 C20orf78Q9BR46 151 aa12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 LINC00315P59091 139 aa12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 CBY3A6NI87 242 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 HTN1P15515 57 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 SYT8Q8NBV8 401 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 TMEM160Q9NX00 188 aa12.34□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 A8MTW9 85 aa12.33□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 NUDT3O95989 172 aa12.33□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
TOM1-216ENST00000492723 F5H697 171 aa12.33□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.33□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R17O96001 155 aa12.32□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 PRSS1P07477 247 aa12.32□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 DKK2Q9UBU2 259 aa12.32□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.32□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.32□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 LY6G6DO95868 133 aa12.31□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 NPSP0C0P6 89 aa12.31□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A34Q6PIV7 304 aa12.31□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.31□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ATP5LO75964 103 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 CSTL1Q9H114 145 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ZNF876PQ49A33 203 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.3□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 STPG4Q8N801 248 aa12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ODF1Q14990 250 aa12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 NEGR1Q7Z3B1 354 aa12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 DLEU1O43261 78 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 PRM2P04554 102 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 TCTAP57738 103 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ZNF56Q15929 161 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 NDUFA7O95182 113 aa12.28□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 K7EMI3 77 aa12.27□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 CRYGDP07320 174 aa12.27□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.27□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 JMJD8Q96S16 334 aa12.27□□□□□ -0.44
TOM1-216ENST00000492723 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 SAP30O75446 220 aa12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 COX8AP10176 69 aa12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 PROK1P58294 105 aa12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 TOMM6Q96B49 74 aa12.26□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 OR11H12B2RN74 326 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 STHQ8IWL8 128 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 LINC01587Q99440 93 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 INSP01308 110 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 GAGE1Q13065 139 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZMAT4Q9H898 229 aa12.25□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 M0QY20 66 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 IGKCP01834 107 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 XCL2Q9UBD3 114 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 VCYO14598 125 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.24□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 DPM2O94777 84 aa12.23□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZNF415Q09FC8 603 aa12.23□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.23□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 KIR2DL4Q99706 377 aa12.23□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WX48 190 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 INAFM1C9JVW0 142 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 PCP4P48539 62 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 NMUP48645 174 aa12.22□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.21□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 M0R2P5 195 aa12.21□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 MPV17L2Q567V2 206 aa12.21□□□□□ -0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.21□□□□□ -0.45
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