RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 HERVK_113P61574 105 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf82Q6UX34 121 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGF1P05019 195 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 HERVK_113P63121 156 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EIM0 57 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA7O95182 113 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX1P56177 255 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PMVKQ15126 192 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A0MQY5 61 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CDSNQ15517 529 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL21O00585 134 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 P0DMU3 169 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM231AP0DMU4 169 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM231CP0DMU5 169 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RBAKDNA6NC62 111 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAC2D3DTV9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 J3KT08 172 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R1B8 84 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R2P5 195 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM101Q96IK0 257 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYGDP07320 174 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX6P56179 175 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 APC2O95996 2303 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNA1BQ00975 2339 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TACC2O95359 2948 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIAP1O43715 76 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-46P01743 117 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF182Q8N6D2 247 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C423 109 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-23P01764 117 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf173Q96LM9 149 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL8P80075 99 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf48Q96LS8 159 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JNJ9 132 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QQQ9 107 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 EBI3Q14213 229 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 AMELXQ99217 191 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9UFV3 132 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0B4J2C4 111 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 M0R381 172 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRQO14949 82 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 MGPP08493 103 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00311Q8N616 119 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 ITPR1Q14643 2758 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 TSHBP01222 138 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.34□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 ACACBO00763 2458 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-203ENST00000439720 POLEQ07864 2286 aa6.33□□□□□ -1.4
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