RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 K7EMI3 77 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 CIDEAO60543 219 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 HSBP1O75506 76 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM6P0DI80 62 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 FABP4P15090 132 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 IGLL1P15814 213 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 APOC4P55056 127 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00310P59036 64 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 SSTP61278 116 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF876PQ49A33 203 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 FA2HQ7L5A8 372 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 C16orf74Q96GX8 76 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RCHY1Q96PM5 261 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RHODO00212 210 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 NUPR1O60356 82 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TNFRSF6BO95407 300 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00315P59091 139 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 IQCJQ1A5X6 159 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 IL17DQ8TAD2 202 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RASL10AQ92737 203 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 A8MZ25 164 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 H7C1H1 209 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 NPYP01303 97 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 CRYGDP07320 174 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 AMTP48728 403 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N8P6 123 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 NRACQ8N912 160 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 AGRNO00468 2067 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01549A6NIU2 74 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 TCAPO15273 167 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 HTN1P15515 57 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 G0S2P27469 103 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 RRN3P1Q2M238 152 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 SORL1Q92673 2214 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1A-202ENST00000409024 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 RS1O15537 224 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SPRY2O43597 315 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 MGPP08493 103 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SMKR1H3BMG3 65 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 NCR2O95944 276 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 AZU1P20160 251 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 F5H697 171 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 M0QY20 66 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 VCYO14598 125 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZWC4 215 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 C18orf15Q96N68 181 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 ST20Q9HBF5 79 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 NIT2Q9NQR4 276 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 MUC4Q99102 2169 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WWL8 130 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LEPROTL1O95214 131 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 HBDP02042 147 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 FCER1GP30273 86 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 LAGE3Q14657 143 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF56Q15929 161 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1A-202ENST00000409024 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.05□□□□□ -1.28
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