RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 LENEPQ9Y5L5 61 aa19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WX48 190 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAC2D3DTV9 90 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EMI3 77 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NRACQ8N912 160 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GAS8-AS1O95177 125 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF152Q8N8N0 203 aa19.79■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 ELANEP08246 267 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 GTSCR1Q86UQ5 136 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 DUX3Q96PT4 197 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC3BP05452 202 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf86Q6ZUL3 223 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL26Q96S19 204 aa19.78■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 NOTCH1P46531 2555 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa19.77■□□□□ 0.76
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CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa19.77■□□□□ 0.76
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PLD3 99 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 F8W1H4 67 aa19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa19.76■□□□□ 0.75
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CAPNS1-201ENST00000246533 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF182Q8N6D2 247 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ORMDL2Q53FV1 153 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf21Q9P2W6 132 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KQE9 123 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C1H1 209 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF20Q53R12 229 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXN1Q5VSR9 72 aa19.74■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV3P03979 118 aa19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM238C9JI98 176 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QR89 54 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-11P01762 117 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXI2Q6ZQN5 318 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf78Q9BR46 151 aa19.72■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 F8VRH5 84 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC140Q96MF4 163 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM2Q9BVW6 85 aa19.71■□□□□ 0.75
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLL5B9A064 214 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1A1P11684 91 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RAX2Q96IS3 184 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 UFC1Q9Y3C8 167 aa19.7■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2E2Q96LR5 201 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TTTY13Q9BZ97 58 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC19AQ6UXS0 136 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GWB2 263 aa19.68■□□□□ 0.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 RPL24P83731 157 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf74Q32Q52 190 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF479Q96JC4 524 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00477Q96M19 166 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 FBN3Q75N90 2809 aa19.68■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM6Q96B49 74 aa19.67■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf3Q8WVX3 66 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H4GQ99525 98 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01549A6NIU2 74 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 K7ERJ3 54 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R381 172 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa19.66■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11H12B2RN74 326 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11H1Q8NG94 326 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 OR11H2Q8NH07 326 aa19.65■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa19.64■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa19.64■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL24O00175 119 aa19.64■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5G2Q06055 141 aa19.64■□□□□ 0.74
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM223BA6NKX1 122 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PF4P02776 101 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM223AQ8IWN6 122 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf92Q96LL3 132 aa19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BUA1 57 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOL1O14753 267 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB3A1Q96QR1 104 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DPH3P1Q9H4G8 78 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV21A0A0B4J279 112 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV12-3P01733 135 aa19.63■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RRN3P1Q2M238 152 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa19.62■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WW49 117 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BVH4 76 aa19.61■□□□□ 0.73
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