RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LINC01545	Q5VT33	79 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	COPS9	Q8WXC6	57 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	DMAC1	Q96GE9	116 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CCL19	Q99731	98 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ERG28	Q9UKR5	140 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		J3QLW9	94 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFA2	O43678	99 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00694	P0DN24	101 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ADCYAP1	P18509	176 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK7	P58062	85 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	XAF1	Q6GPH4	301 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		0.38	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	KDM5C	P41229	1560 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		K7EP13	123 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CCK	P06307	115 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IL7	P13232	177 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CAV3	P56539	151 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SPCS2	Q15005	226 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CSAG1	Q6PB30	78 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SMR3A	Q99954	134 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM107B	Q9H098	131 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RERGL	Q9H628	205 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	COA4	Q9NYJ1	87 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CPD	O75976	1380 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM25A	B3EWG3	89 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM25C	B3EWG5	89 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM25G	B3EWG6	89 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFB6	O95139	128 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IFNA17	P01571	189 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IGKC	P01834	107 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A6	P12236	298 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	EMX2	Q04743	252 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF56	Q15929	161 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	OR2T2	Q6IF00	324 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TSKU	Q8WUA8	353 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ARL11	Q969Q4	196 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM141	Q96I45	108 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RPRM	Q9NS64	109 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	BET1L	Q9NYM9	111 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NAIP	Q13075	1403 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	KNTC1	P50748	2209 aa		0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RBAKDN	A6NC62	111 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SNCG	O76070	127 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	APOD	P05090	189 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IL5	P05113	134 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PIRT	P0C851	137 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FGF7	P21781	194 aa		0.35	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35

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