RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526550.1

PTPRJ-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-203ENST00000526550 CIDEAO60543 219 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TCRAP04437 139 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 WFDC2Q14508 124 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SMUG1Q53HV7 270 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 Q8N3U1 123 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GGTLC3B5MD39 225 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GCHFRP30047 84 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DEFA1P59665 94 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DEFA3P59666 94 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LAGE3Q14657 143 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC01620Q4KN68 170 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TOR2AQ5JU69 321 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 BAALCQ8WXS3 180 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 C9orf85Q96MD7 179 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ASIPP42127 132 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 IFITM3Q01628 133 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 RAB24Q969Q5 203 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 RMI2Q96E14 147 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PARLQ9H300 379 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 A8MWV9 139 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 H3BVH4 76 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 CXorf1O96002 111 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 IFNA7P01567 189 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 MBP02144 154 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 C1QBP02746 253 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 STAG3L2P0CL84 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 STAG3L3P0CL85 134 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LCE2CQ5TA81 110 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 BATF3Q9NR55 127 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 EPDR1Q9UM22 224 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 MYCBP2O75592 4640 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 A0A087WWC5 75 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 A6NHS1 94 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRJ-203ENST00000526550 ATP6V0CP27449 155 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 UBE2G2P60604 165 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SCXQ7RTU7 201 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SYT8Q8NBV8 401 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PTH2Q96A98 100 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 UBE2WQ96B02 151 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC00479Q96M42 142 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 JPT2Q9H910 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 Q9UF83 564 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRJ-203ENST00000526550 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRJ-203ENST00000526550 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRJ-203ENST00000526550 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 M0R381 172 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 RHODO00212 210 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 SEC11BP0C7V7 166 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC00694P0DN24 101 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 Q6ZSA8 131 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 Q86TA4 180 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 Q8N976 141 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-203ENST00000526550 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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