RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 ANK2Q01484 3957 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 UBL3O95164 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZS92 163 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00311Q8N616 119 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR31O00270 319 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SPINT3P49223 89 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP35Q8NFH5 326 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF563Q8TA94 476 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PATE1Q8WXA2 126 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 COX14Q96I36 57 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX37Q96LM6 180 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GV72 72 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 GADD45GO95257 159 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP5-9P26371 169 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DYNLT3P51808 116 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 LTC4SQ16873 150 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 LCN9Q8WX39 176 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MCEEQ96PE7 176 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS13CQ709C8 3753 aa3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf70A6NJV1 201 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 CRHP06850 196 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP12-4P60329 112 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8IYB0 196 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCA4P78363 2273 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMM17BO60830 172 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PROSCO94903 275 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TRGC2P03986 189 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MAXP61244 160 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 RHOGP84095 191 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DYDC1Q8WWB3 177 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 NPCDR1Q9BY65 106 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DOCK4Q8N1I0 1966 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 H0YJX3 145 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNA14P01570 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DR1Q01658 176 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM78Q5T7P6 136 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1I1O60431 355 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 LYZL6O75951 148 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNA21P01568 189 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 CMPK1P30085 196 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 Q8N2B8 174 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 POPDC3Q9HBV1 291 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MED11Q9P086 117 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 POLEQ07864 2286 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 SONP18583 2426 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD36A6QL64 1941 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 A8MWV9 139 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 MYL5Q02045 173 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE6HQ13956 83 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.97□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.96□□□□□ -1.93
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CXCL1P09341 107 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 BRS3P32247 399 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 PLGLB1Q02325 96 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10K1Q8NGX5 313 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 CR1P17927 2039 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RYR3Q15413 4870 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-205ENST00000514178 UQCRHLA0A096LP55 91 aa2.95□□□□□ -1.94
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