RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 OCC1Q8TAD7 63 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 TPPP3Q9BW30 176 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 C9JQL5 133 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF876PQ49A33 203 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 LCE6AA0A183 80 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 XKRY2A2RUG3 117 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 K7EN84 100 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ERVFC1-1P60608 527 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SSTP61278 116 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SYT8Q8NBV8 401 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R381 172 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 SFTA3P0C7M3 94 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 ADIRFQ15847 76 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf85Q96MD7 179 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 IL36BQ9NZH7 164 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 GZMBP10144 247 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01551Q86U37 167 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 COMMD7Q86VX2 200 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT11Q96G61 164 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 NAT8Q9UHE5 227 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 RASL10AQ92737 203 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.46□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0J9YY99 117 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP82Q8N141 532 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.45□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT3O95989 172 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXA5P20719 270 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 DNLZQ5SXM8 178 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF479Q96JC4 524 aa9.44□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCL1P09341 107 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 MED14OSP0DP75 135 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 UQCC3Q6UW78 93 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 C18orf15Q96N68 181 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.43□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MWV9 139 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 PAX4O43316 350 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 ISOC2Q96AB3 205 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM210BQ96KR6 192 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.42□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087WWL8 130 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPQ1 181 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MWL6 223 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 F8W036 122 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 RS1O15537 224 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5AL1P0C617 328 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 TCTAP57738 103 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 PTH2Q96A98 100 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 BORCS7Q96B45 105 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 SFRP2Q96HF1 295 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 JPT2Q9H910 190 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.41□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 F2Z2F3 143 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM17P0DL12 118 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNG7P62955 275 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 SLAQ13239 276 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 FHL2Q14192 279 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 OSTCQ9NRP0 149 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-204ENST00000503638 PRO0255Q9UI72 69 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms