RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 BLOC1S1P78537 153 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF876PQ49A33 203 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLST8Q9BVC4 326 aa13.33□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDE6DO43924 150 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 LINC01559Q495D7 138 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRO0255Q9UI72 69 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 VAX2Q9UIW0 290 aa13.32□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1B0GVY2 172 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 H3BVH4 76 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PAX4O43316 350 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRYBA4P53673 196 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLAQ13239 276 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 CENPWQ5EE01 88 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.31□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.3□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTC32Q5I0X7 151 aa13.3□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRR27Q6MZM9 219 aa13.3□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL36BQ9NZH7 164 aa13.3□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A096LPF7 62 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNLZQ5SXM8 178 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 C6orf223Q8N319 242 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTH2Q96A98 100 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 Q9H8V8 135 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 MED9Q9NWA0 146 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.29□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ESRGQ1W209 222 aa13.28□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.28□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.28□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.27□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNG4P50150 75 aa13.27□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 UPK3BQ9BT76 320 aa13.27□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.27□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB19A4D1S5 217 aa13.26□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RS1O15537 224 aa13.26□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF575Q86XF7 245 aa13.26□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV2-8P01709 118 aa13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.25□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 GYPEP15421 78 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SYT8Q8NBV8 401 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMIM12Q96EX1 92 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.24□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 A8MWV9 139 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 K7EQD1 137 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 CXCL1P09341 107 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TOR2AQ5JU69 321 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PARLQ9H300 379 aa13.23□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 CIDEAO60543 219 aa13.22□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 MED14OSP0DP75 135 aa13.22□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SRIP30626 198 aa13.22□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 JPT2Q9H910 190 aa13.22□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 A0A1W2PPQ1 181 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM250H0YL14 139 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0R381 172 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNP2Q05952 138 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFP82Q8N141 532 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKHD1P08F94 4074 aa13.21□□□□□ -0.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RHOHQ15669 191 aa13.2□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX261Q6UWH6 196 aa13.2□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.2□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIVA1O15304 175 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 NXPH4O95158 308 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM210AQ96ND0 272 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 RHODO00212 210 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNAI2O43623 268 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 BIN3Q9NQY0 253 aa13.18□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 P01737 135 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR5AL1P0C617 328 aa13.17□□□□□ -0.3
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEBPGP53567 150 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms