RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486599.1

TAF4-204, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 4, human

TSL 2

Gene TAF4, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF4-204	ENST00000486599	CIDEA	O60543	219 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TAF4-204	ENST00000486599	GCG	P01275	180 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TAF4-204	ENST00000486599	TCRA	P04437	139 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TAF4-204	ENST00000486599	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TAF4-204	ENST00000486599	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TAF4-204	ENST00000486599	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	LECT2	O14960	151 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	LAGE3	Q14657	143 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	PTH2	Q96A98	100 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	TM2D2	Q9BX73	214 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599		K7EQM0	130 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	C1QB	P02746	253 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GCHFR	P30047	84 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	SMUG1	Q53HV7	270 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599		Q9UF83	564 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GAGE12J	A6NER3	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GAGE1	Q13065	139 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GAGE4	Q13068	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GAGE5	Q13069	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	GAGE13	Q4V321	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	PARL	Q9H300	379 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	ZFP69	Q49AA0	526 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599		Q6ZSA8	131 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	LINC00694	P0DN24	101 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	JPT2	Q9H910	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TAF4-204	ENST00000486599	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		A8MWV9	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	BAALC	Q8WXS3	180 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	CXorf1	O96002	111 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	DEFA1	P59665	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	DEFA3	P59666	94 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ASIP	P42127	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		A0A087WWC5	75 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	MB	P02144	154 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	SERF2	P84101	59 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	TOR2A	Q5JU69	321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	AQP10	Q96PS8	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		H3BVH4	76 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		A0A1W2PRE2	83 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		A6NHS1	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599		B4DEV8	164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	IFNA7	P01567	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	CRIP1	P50238	77 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	NIT1	Q86X76	327 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	COX11	Q9Y6N1	276 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TAF4-204	ENST00000486599	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TAF4-204	ENST00000486599	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TAF4-204	ENST00000486599		M0R036	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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