RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NACAE9PAV3 2078 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0J9YY99 117 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB19A4D1S5 217 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 PAX4O43316 350 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 TOR2AQ5JU69 321 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 SYT8Q8NBV8 401 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.78□□□□□ -0.68
PGGT1B-202ENST00000379615 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.77□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF212Q495C1 297 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM210AQ96ND0 272 aa10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BVH4 76 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL18P55774 89 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FHL2Q14192 279 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF479Q96JC4 524 aa10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.76□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 XKRY2A2RUG3 117 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 A8MWV9 139 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RS1O15537 224 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 SFTA3P0C7M3 94 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 MED14OSP0DP75 135 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB14P61106 215 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 PARLQ9H300 379 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.74□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 CEBPGP53567 150 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBA4P53673 196 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP82Q8N141 532 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 P01737 135 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 PEA15Q15121 130 aa10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 OCC1Q8TAD7 63 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-202ENST00000379615 LY96Q9Y6Y9 160 aa10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF575Q86XF7 245 aa10.71□□□□□ -0.69
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A096LPF7 62 aa10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF727A8MUV8 499 aa10.7□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAI2O43623 268 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GYPEP15421 78 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 SRIP30626 198 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOHQ15669 191 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.69□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT11Q96G61 164 aa10.69□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 TPPP3Q9BW30 176 aa10.68□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 CACNG7P62955 275 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.67□□□□□ -0.7
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PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.67□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLC6P0CF74 106 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GZMBP10144 247 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVFC1-1P60608 527 aa10.65□□□□□ -0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01551Q86U37 167 aa10.65□□□□□ -0.7
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