RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 PDE6DO43924 150 aa17.31■□□□□ 0.36
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CXCL2-201ENST00000296031 DERL1Q9BUN8 251 aa17.31■□□□□ 0.36
CXCL2-201ENST00000296031 BLOC1S1P78537 153 aa17.3■□□□□ 0.36
CXCL2-201ENST00000296031 ESRGQ1W209 222 aa17.3■□□□□ 0.36
CXCL2-201ENST00000296031 LINC01559Q495D7 138 aa17.3■□□□□ 0.36
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CXCL2-201ENST00000296031 ZNRF2Q8NHG8 242 aa17.3■□□□□ 0.36
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CXCL2-201ENST00000296031 H3BVH4 76 aa17.29■□□□□ 0.36
CXCL2-201ENST00000296031 CFAP126Q5VTH2 177 aa17.29■□□□□ 0.36
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CXCL2-201ENST00000296031 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa17.26■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZR54 194 aa17.26■□□□□ 0.35
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CXCL2-201ENST00000296031 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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CXCL2-201ENST00000296031 K7EQD1 137 aa17.24■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 LYPD6BQ8NI32 183 aa17.24■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 SCRT2Q9NQ03 307 aa17.24■□□□□ 0.35
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CXCL2-201ENST00000296031 UPK3BQ9BT76 320 aa17.23■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 Q9H8V8 135 aa17.23■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 A8MWV9 139 aa17.22■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 IGLV2-8P01709 118 aa17.22■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 RPL19P84098 196 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
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CXCL2-201ENST00000296031 SYT8Q8NBV8 401 aa17.22■□□□□ 0.35
CXCL2-201ENST00000296031 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa17.22■□□□□ 0.35
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CXCL2-201ENST00000296031 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa17.2■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 RBFOX3A6NFN3 312 aa17.19■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 MED14OSP0DP75 135 aa17.18■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 RTL8CO15255 209 aa17.17■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 ZFP82Q8N141 532 aa17.17■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 PRADC1Q9BSG0 188 aa17.17■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 SAMD10Q9BYL1 202 aa17.17■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 LINC00336Q6ZUF6 198 aa17.16■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 NXPH4O95158 308 aa17.15■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 SOHLH1Q5JUK2 328 aa17.15■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 UFSP1Q6NVU6 142 aa17.15■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZSN1 163 aa17.15■□□□□ 0.34
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CXCL2-201ENST00000296031 SFRP2Q96HF1 295 aa17.15■□□□□ 0.34
CXCL2-201ENST00000296031 C19orf71A6NCJ1 209 aa17.14■□□□□ 0.33
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CXCL2-201ENST00000296031 BIN3Q9NQY0 253 aa17.14■□□□□ 0.33
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CXCL2-201ENST00000296031 FAM74A4Q5TZK3 123 aa17.13■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 A0A087WWL8 130 aa17.12■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 SIVA1O15304 175 aa17.12■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 SNAI2O43623 268 aa17.12■□□□□ 0.33
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CXCL2-201ENST00000296031 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 TEX261Q6UWH6 196 aa17.11■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa17.11■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 MUC21A0A140T8X8 626 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 PRSS29PA6NIE9 313 aa17.1■□□□□ 0.33
CXCL2-201ENST00000296031 P01737 135 aa17.1■□□□□ 0.33
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