RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637500.1

TCF4-287, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-287	ENST00000637500	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		-3.02	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	-3.02	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	PAPPA	Q13219	1627 aa		-3.02	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	PIK3C2A	O00443	1686 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	hADV38S2	A0JD32	116 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	CXCL1	P09341	107 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	DNAJB13	P59910	316 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	SPCS3	P61009	180 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	TRIM4	Q9C037	500 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	GLTP	Q9NZD2	209 aa		-3.03	□□□□□ -2.89
TCF4-287	ENST00000637500	LRP6	O75581	1613 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CDC42EP2	O14613	210 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	OR2H2	O95918	312 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TCL1A	P56279	114 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	MYL6	P60660	151 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	FADD	Q13158	208 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	POU6F1	Q14863	301 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	LRP5	O75197	1615 aa		-3.04	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	RELN	P78509	3460 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500		A0A1B0GW64	132 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CNIH1	O95406	144 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TRAC	P01848	142 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	APOA1	P02647	267 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CCL3L1	P16619	93 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	BLVRA	P53004	296 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	UBE2G2	P60604	165 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PMS2P3	Q13401	168 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	HIST3H3	Q16695	136 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	LRRK2	Q5S007	2527 aa		-3.05	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CHP2	O43745	196 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	MFSD11	O43934	449 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	HIST1H2BK	O60814	126 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	ATP5H	O75947	161 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	COX5B	P10606	129 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	FABP4	P15090	132 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TMBIM6	P55061	237 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		-3.06	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	ZNF609	O15014	1411 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	RTL9	Q8NET4	1388 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TMEM189	A5PLL7	270 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DEGS1	O15121	323 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CST8	O60676	142 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CARD18	P57730	90 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	MT1H	P80294	61 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		-3.07	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	KNL1	Q8NG31	2342 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	APOC1	P02654	83 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CCDC172	P0C7W6	258 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DEFA5	Q01523	94 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	DRC3	Q9H069	523 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		-3.08	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PTPRG	P23470	1445 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	FABP12	A6NFH5	140 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500		M0QZ92	97 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	APOE	P02649	317 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	INSL3	P51460	131 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	NDUFA6	P56556	154 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PIGY	Q3MUY2	71 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	ADGRB1	O14514	1584 aa		-3.09	□□□□□ -2.9
TCF4-287	ENST00000637500	PIK3C2G	O75747	1445 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	NFYB	P25208	207 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	OMP	P47874	163 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	ERVS71-1	P61550	626 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	CLEC2B	Q92478	149 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	BORCS7	Q96B45	105 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	C8orf76	Q96K31	380 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	PARVB	Q9HBI1	364 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500		V9GYV3	84 aa		-3.1	□□□□□ -2.91
TCF4-287	ENST00000637500	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		-3.1	□□□□□ -2.91

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