RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.56	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GV72	72 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573		M0R2Z0	102 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	HSBP1	O75506	76 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ORM2	P19652	201 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	INSL3	P51460	131 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.55	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	MPDU1	O75352	247 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC11A	P67812	179 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	LYST	Q99698	3801 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.54	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	C7orf71	A4D174	169 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573		A6NJY4	79 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BTX0	84 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ISLR	O14498	428 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	C8orf88	P0DMB2	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	MORN5	Q5VZ52	161 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM231B	A6NCW3	169 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	SPINK4	O60575	86 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	GCHFR	P30047	84 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		7.52	□□□□□ -1.2
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		H3BRM9	83 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		K7EP34	96 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	GNG4	P50150	75 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.52	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	HELT	A6NFD8	242 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	METTL26	Q96S19	204 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	SIGMAR1	Q99720	223 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	MGST2	Q99735	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	SLA	Q13239	276 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.51	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	AZU1	P20160	251 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	KNCN	A6PVL3	124 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		K7EMT4	169 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	BUB3	O43684	328 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV3-20	P01619	116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TCL1A	P56279	114 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	DEFB131A	P59861	70 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	RAB31	Q13636	194 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	CFAP161	Q6P656	301 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	C17orf77	Q96MU5	243 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087X0K7	114 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		A6NDN8	102 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573		F6UB75	175 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	HLA-DMB	P28068	263 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FAM227B-208	ENST00000559573	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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