RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1B0GV50	99 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570		M0R3E3	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TAAR5	O14804	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	INS	P01308	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	HBE1	P02100	147 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	MB	P02144	154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	GPX1	P07203	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGLC2	P0DOY2	106 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	MIF	P14174	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	M6PR	P20645	277 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TSPO	P30536	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	LEP	P41159	167 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	PRELID1	Q9Y255	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A0D9SG52	128 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGLL5	B9A064	214 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IFNA7	P01567	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	CXCL2	P19875	107 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	CDKN1B	P46527	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	FHIT	P49789	147 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	UBE2G2	P60604	165 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	HERV-K104	P63124	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	SERF2	P84101	59 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	VGLL1	Q99990	258 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570		Q9H3A6	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATXN3-222	ENST00000553570	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570		K7EQM0	130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	LY6G6C	O95867	125 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	CXorf1	O96002	111 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	AZU1	P20160	251 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	GCHFR	P30047	84 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	DAD1	P61803	113 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	GNG5	P63218	68 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	C11orf52	Q96A22	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	SPX	Q9BT56	116 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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