RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534946.5

LMO3-211, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 1,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-211ENST00000534946 TCTAP57738 103 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 CELA1Q9UNI1 258 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TCL1AP56279 114 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 CCL20P78556 96 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TEX261Q6UWH6 196 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 Q6ZTC4 211 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TVP23CQ96ET8 276 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 SMIM12Q96EX1 92 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 SGK494Q96LW2 274 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 NAGKQ9UJ70 344 aa8.36□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 AZU1P20160 251 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 C12orf74Q32Q52 190 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 FAM210BQ96KR6 192 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 LINC00479Q96M42 142 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 C8orf49Q96NF6 230 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 SPXQ9BT56 116 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.35□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 TMEM250H0YL14 139 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 MUC21Q5SSG8 566 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.34□□□□□ -1.07
LMO3-211ENST00000534946 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ATP5G1P05496 136 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DEFB130BP0DP73 79 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DEFB130AP0DP74 79 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 BAGE2Q86Y30 109 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 C18orf15Q96N68 181 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.33□□□□□ -1.08
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LMO3-211ENST00000534946 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 PRM2P04554 102 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GNG4P50150 75 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 FAM210AQ96ND0 272 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 MED9Q9NWA0 146 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.31□□□□□ -1.08
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LMO3-211ENST00000534946 TYMSP04818 313 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ASIPP42127 132 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 CENPWQ5EE01 88 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 MLST8Q9BVC4 326 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GAGE12BA1L429 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 B4DEV8 164 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 C9JCJ5 164 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 M0R2P5 195 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 SH2D1AO60880 128 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GAGE7O76087 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 CXCL1P09341 107 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GAGE12FP0CL80 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GAGE12GP0CL81 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 GAGE12IP0CL82 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 RAB14P61106 215 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 ORM1P02763 201 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 HTN3P15516 51 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 Q6ZQT7 251 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 Q6ZTI0 123 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DERL1Q9BUN8 251 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 MDFICQ9P1T7 246 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 IGLL5B9A064 214 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 SLAQ13239 276 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 OR5I1Q13606 314 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DNLZQ5SXM8 178 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 PRR27Q6MZM9 219 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 RASL10AQ92737 203 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 PTH2Q96A98 100 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 C9orf85Q96MD7 179 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-211ENST00000534946 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.28□□□□□ -1.08
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