RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	MRAP2	Q96G30	205 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	COL6A3	P12111	3177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	KALRN	O60229	2985 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		F8W1H4	67 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		H7C1H1	209 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CIDEA	O60543	219 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A16	P16260	332 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	AZU1	P20160	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR9	Q5T870	116 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N9W7	124 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	TOMM6	Q96B49	74 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	POLE	Q07864	2286 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZZEF1	O43149	2961 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		F8VRH5	84 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EMI3	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R381	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NXPH4	O95158	308 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM11	P17152	192 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	EFNA4	P52798	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	HES1	Q14469	280 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZQT7	251 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	RASL10A	Q92737	203 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMD4	Q96H15	378 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V0B	Q99437	205 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SIRPD	Q9H106	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM160	Q9NX00	188 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TACC2	O95359	2948 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ACACA	Q13085	2346 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMA5	O15230	3695 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	OR11H12	B2RN74	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFS8	O00217	210 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SOCS3	O14543	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LY6H	O94772	140 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GOSR1	O95249	250 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC3B	P05452	202 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	COX6B1	P14854	86 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2D1	P51668	147 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00315	P59091	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GPHB5	Q86YW7	130 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	OR11H1	Q8NG94	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	OR11H2	Q8NH07	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C20orf173	Q96LM9	149 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTA1	P02549	2419 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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