RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 CXorf1O96002 111 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 IGLV2-11P01706 119 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 CRYBA4P53673 196 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF575Q86XF7 245 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PRO0255Q9UI72 69 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.7□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ARPC5O15511 151 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TTC32Q5I0X7 151 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 RASL10AQ92737 203 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SPXQ9BT56 116 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PSG8Q9UQ74 426 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.69□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 M0R2P5 195 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 NXPH4O95158 308 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 GCGP01275 180 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 UBE2G2P60604 165 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PRNTQ86SH4 94 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 EPDR1Q9UM22 224 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 FAT1Q14517 4588 aa5.68□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PPQ1 181 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PRE2 83 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 K7EQD1 137 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 K7EQM0 130 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 MED14OSP0DP75 135 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SLAQ13239 276 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNS1Q96KK3 526 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 LINC00479Q96M42 142 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.67□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM74A7A6NL05 159 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 C9JCJ5 164 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PEX7O00628 323 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 TAAR5O14804 337 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SIVA1O15304 175 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 GYPEP15421 78 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SRIP30626 198 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 FHITP49789 147 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 LINC00315P59091 139 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ZFP69Q49AA0 526 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 SMUG1Q53HV7 270 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 Q86TA4 180 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 C9orf85Q96MD7 179 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.66□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 C16orf90A8MZG2 172 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 IFNA7P01567 189 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 RS1O15537 224 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 ORM1P02763 201 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF345Q14585 488 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF876PQ49A33 203 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.64□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1B0GV50 99 aa5.63□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 BCL2L11O43521 198 aa5.63□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 CRIP1P50238 77 aa5.63□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 PPT1P50897 306 aa5.63□□□□□ -1.51
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP10-2P60368 255 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms