RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395422.3

CHCHD2-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD2, Length 901 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2-201ENST00000395422 VAMP2P63027 116 aa8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 RHOHQ15669 191 aa8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 FXYD5Q96DB9 178 aa8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 RBAKDNA6NC62 111 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 IGLV2-11P01706 119 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 FGF7P21781 194 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 OR51M1Q9H341 326 aa8.75□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 IGSF23A1L1A6 192 aa8.74□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 C5orf51A6NDU8 294 aa8.74□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 Q8N976 141 aa8.74□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 MITD1Q8WV92 249 aa8.74□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 RANP62826 216 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 PAXXQ9BUH6 204 aa8.73□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.73□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.73□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 DIRC3C9JPN6 131 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 F6UZH7 168 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 LINC00694P0DN24 101 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 S100A11P31949 105 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 BTCP35070 178 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 CSN1S1P47710 185 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 SULT1A1P50225 295 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF876PQ49A33 203 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 TVP23CQ96ET8 276 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 Q9UF83 564 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 COX11Q9Y6N1 276 aa8.72□□□□□ -1.01
CHCHD2-201ENST00000395422 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GGTLC3B5MD39 225 aa8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ASIPP42127 132 aa8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TOR2AQ5JU69 321 aa8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE12JA6NER3 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 FAM25EA8MYX2 175 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 INPP1P49441 399 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE1Q13065 139 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE4Q13068 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE5Q13069 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GAGE13Q4V321 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 THAP6Q8TBB0 222 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.7□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.69□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TMED6Q8WW62 240 aa8.69□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ASB13Q8WXK3 278 aa8.69□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.69□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 PANO1I0J062 215 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 OR7C2O60412 319 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 CIDEAO60543 219 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 HBG1P69891 147 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 HBG2P69892 147 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TRIQKQ629K1 86 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 STX12Q86Y82 276 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 RMI2Q96E14 147 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 HYLS1Q96M11 299 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 KLK12Q9UKR0 248 aa8.68□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 S100A10P60903 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 IL15RAQ13261 267 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ODF1Q14990 250 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP6V1FQ16864 119 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 Q6ZRU5 148 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 NIT1Q86X76 327 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 UBE2WQ96B02 151 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 KCNS1Q96KK3 526 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 C9orf85Q96MD7 179 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ATP5SQ99766 215 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 NHLH2Q02577 135 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 RAB32Q13637 225 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 TREM1Q9NP99 234 aa8.66□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 C2orf50Q96LR7 162 aa8.65□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 PARLQ9H300 379 aa8.65□□□□□ -1.02
CHCHD2-201ENST00000395422 A0A087WWC5 75 aa8.64□□□□□ -1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 PGPA6NDG6 321 aa8.64□□□□□ -1.03
CHCHD2-201ENST00000395422 GNG5P63218 68 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms